Знайдено новий клас АТP-конкурентних інгібіторів протеїнкінази ASK1 людини

2011 Протеїнкіназа ASK1 (Apoptosis signal-regulating kinase 1) відіграє важливу роль у процесах диференціювання, старіння, запалення та апоптозу залежно від типу та контексту клітин. Підвищена активність протеїнкінази пов’язана з виникненням багатьох патологій. Це є передумовою для розробки перспективних інгібіторів ASK1, що можуть бути використані в медичній терапії. За допомогою методів комп’ютерного моделювання та біохімічного тестування знайдено інгібітор протеїнкінази ASK1 серед похідних 3Н-нафто[1,2,3-де]хінолін-2,7-діонів. Показано, що сполука етил 2,7-диоксо-2,7-дигідро-3Н-нафто[1,2,3-де]хінолін-1-карбоксилат пригнічувала активність протеїнкінази ASK1 зі значенням Kі 500 nM. Результати кінетичних експериментів свідчать про конкурентний характер інгібування. Перевірка активності цієї сполуки на семи протеїнкіназах людини продемонструвала значну селективність стосовно ASK1. Посилання: Volynets GP, Chekanov OM, Synyugin AR, Golub AG, Kukharenko OP, Bdzhola VG, Yarmoluk SM. Identification of 3H-Naphtho[1,2,3-de]quinoline-2,7-diones as Inhibitors of Apoptosis Signal-Regulating Kinase 1 (ASK1) http://pubs.acs.org/doi/abs/10.1021/jm200117h

 

Знайдено новий клас високоактивних АТP-конкурентних інгібіторів СК2 людини

2011 Нещодавно було знайдено новий клас високоактивних АТP-конкурентних інгібіторів СК2 людини. Було синтезовано і тестовано низку похідних (тієно[2,3-де]піримідин-4-ілтіо)карбоксилової кислоти. Найбільш активні сполуки 3-{[5-(4-метилфеніл)тієно[2,3-де]піримідин-4-іл]тіо} пропанова кислота та 3-{[5-(4-етоксифеніл)тієно[2,3-де]піримідин-4-іл]тіо} пропанова кислота інгібують протеїнкіназу СК2 зі значенням IC50 0,1 та 0,125 µM відповідно. Перевірка активності цих речовин на семи протеїнкіназах людини продемонструвала значну селективність стосовно СК2. Залежність «хімічна структура – біологічна активність» досліджено для 28 похідних тієнопіримідинів. Для сполук цього класу запропоновано модель зв’язування з активним центром ензиму. Посилання: Golub AG, Bdzhola VG, Briukhovetska NV, Balanda AO, Kukharenko OP, Kotey IM, Ostrynska OV, Yarmoluk SM. Synthesis and biological evaluation of substituted (thieno[2,3-d]pyrimidin-4-ylthio)carboxylic acids as inhibitors of human protein kinase CK2. Eur. J. Med. Chem. 2011; doi:10.1016/j.ejmech.2010.12.025.

 

Розпочато спільний проект УНТЦ та НАНУ

2010 У вересні 2010 року розпочато спільний проект УНТЦ та НАНУ № 5218 «Раціональний пошук інгібіторів аміноацил-тРНК синтетаз із селективною дією проти збудника туберкульозу 2010-2012». На першому етапі роботи розроблено модель просторової структури ЛейРС M. tuberculosis із використанням методу моделювання по гомології. Одержану модель буде використано для віртуального скринінгу комбінаторної бібліотеки хімічних сполук.

 

VI Міжнародна конференція, присвячена протеїнкіназі СК2

2010 7-10 вересня 2010 року Андрій Голуб та Володимир Бджола взяли участь у VI Міжнародній конференції, присвяченій протеїнкіназі СК2 (Кельн, Німеччина). Наші співробітники ознайомилися з останніми досягненнями в галузі розробки інгібіторів протеїнкінази СК2. На конференції нашими вченими була представлена усна доповідь «New Compounds Inhibiting an Old Kinase».

 

ІІІ Міжнародний симпозіум, присвячений використанню методів комп’ютерної хімії

2009 28 червня – 2 липня 2009 року Андрій Голуб та Володимир Бджола взяли участь у ІІІ Міжнародному симпозіумі, присвяченому використанню методів комп’ютерної хімії (Одеса, Україна). На конференції наші вчені виступили з усною доповіддю «Computer-aided desing of novel protein kinase CK2 inhibitors».

 

Захист дисертаційної роботи

23.09.2008 Київ, Україна Співробітник групи молекулярного дизайну Олександр Яковенко успішно захистив дисертацію за спеціальністю "Біотехнологія" на тему "Розробка технології передбачення спорідненості органічних сполук до молекулярно-біологічних мішеней для рецептор-орієнтованого віртуального скринінгу in silico". Ми вітаємо нашого колегу з цим видатним досягненням.

 

Конференція по інгібіторах протеїнкіназ (IPK 2005 Conference)

25.06.2005 - 29.06.2005 Варшава, Польща Володимир Бджола, Андрій Голуб та Олександр Яковенко брали участь у Четвертій конференції по інгібіторах протеїнкіназ (4th International Conference on Inhibitors of Protein Kinases and Workshop Modelling of Specific Molecular Recognition Processes), яка відбулася 25-29 червня 2005 р. у м. Варшава, Польща. На постерній сесії було представлено два постери: Evaluation of 3-Carboxy-4-(1H)-Quinolones as Inhibitors of Human Protein Kinase CK2 Implementation of orbital graph model for partial atom charges definition in virtual screening technique

Кластер для квантово-механічних та молекулярно-механічних розрахунків

2005 У 2005 р. в рамках програми з розробки інгібіторів протеїнкіназ уведено в дію кластер для квантово-механічних та молекулярно-механічних розрахунків. Кластер складається з 8 розрахункових нод (P4 3.2GHz, 1Gb of memory, Linux OS) і дозволяє проводити рецептор-орієнтований віртуальний скринінг комбінаторних бібліотек до 500 000 хімічних сполук на місяць.

© ВІДДІЛ КОМБІНАТОРНОЇ ХІМІЇ